Поворотным для Щаранского стал девятый год заключения. 11 февраля 1986 года в сопровождении четырех офицеров КГБ он был вывезен в аэропорт. Щаранскому дали право выбирать свой дальнейший путь. После вопроса конвоя «Куда мы летим: на Восток или на Запад?» Щаранский без промедления выбрал Запад. После приезда ему вручили документ о выдворении из страны и лишении советского гражданства. На Западе Щаранский возобновил свою деятельность в защиту свободы эмиграции. В декабре 1987 года, накануне советско-американской встречи в верхах, он организовал в Вашингтоне крупнейший марш протеста. В 1989 году президент США Рональд Рейган наградил его медалью Свободы. Во время визита Щаранского в Израиль его пришла встречать целая толпа юношей и девушек, в руках некоторых из них были Торы. Перед тем как спуститься по трапу, Щаранский надел кипу.
      По его инициативе в Израиле был создал Сионистский форум – общественная организация, занимавшаяся проблемами абсорбции (обустройства, вживания) репатриантов из Советского Союза. В июле 1995 года он объявил о создании нового политического движения выходцев из бывшего СССР – «Исраэль ба-Алия».